Atap masjid Godhegan berbentuk segitiga kerucut yang terbuat dari kayu jati terdiri dari 2 susun. Secara kultural, masjid At Taqwa Godhegan berada dibawah Masjid Gede Kauman Yogyakarta yang bertingkat 3. Konon KH Imam Nawai pendiri masjid Godhegan merupakan kerabat keraton yang memilih melanglang ke Timur gunung Lawu pasca Pangeran Diponegoro ditawan Belanda.(KOMPAS.com/SUKOCO)